Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3250E9Q1M3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm3250E9Q1M3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3250E9Q1M3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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