Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms