Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms