Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30cD3YVI9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30cD3YVI9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms