Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apol6B7ZC55 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms