Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms