Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clrn2B2RVW2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms