Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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