Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms