Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trabd2bB1ATG9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trabd2bB1ATG9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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