Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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