Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms