Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabreA2AMW3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms