Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb4A2A863 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb4A2A863 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms