Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip6Q9Z1Y4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms