Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ilf3Q9Z1X4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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