Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cldn3Q9Z0G9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn3Q9Z0G9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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