Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms