Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms