Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorbs3Q9R1Z8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorbs3Q9R1Z8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms