Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms