Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc3Q9R0B6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms