Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn8Q9QZ49 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms