Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd4Q9QY39 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms