Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr2e3Q9QXZ7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms