Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms