Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall2Q9QX96 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall2Q9QX96 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms