Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms