Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms