Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg3Q9JL95 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms