Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ldb3Q9JKS4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms