Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnga3Q9JJZ8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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