Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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