Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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