Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ush1cQ9ES64 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms