Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trhr2Q9ERT2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms