Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Wdr61Q9ERF3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms