Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

Ctrl, Chymopasin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtrlQ9ER05 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CtrlQ9ER05 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CtrlQ9ER05 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CtrlQ9ER05 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CtrlQ9ER05 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CtrlQ9ER05 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms