Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms