Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Tspan4Q9DCK3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tspan4Q9DCK3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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