Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms