Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pop5Q9DB28 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pop5Q9DB28 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pop5Q9DB28 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pop5Q9DB28 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms