Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms