Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms