Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms