Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs5Q9D920 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms