Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tvp23bQ9D8T4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tvp23bQ9D8T4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms