Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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