Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm5Q9D7I9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm5Q9D7I9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms