Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms